[백준] 1969번: DNA (python)

1969번: DNA

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문제 )

DNA란 어떤 유전물질을 구성하는 분자이다. 이 DNA는 서로 다른 4가지의 뉴클레오티드로 이루어져 있다(Adenine, Thymine, Guanine, Cytosine). 우리는 어떤 DNA의 물질을 표현할 때, 이 DNA를 이루는 뉴클레오티드의 첫글자를 따서 표현한다. 만약에 Thymine-Adenine-Adenine-Cytosine-Thymine-Guanine-Cytosine-Cytosine-Guanine-Adenine-Thymine로 이루어진 DNA가 있다고 하면, “TAACTGCCGAT”로 표현할 수 있다.

 

 그리고 Hamming Distance란 길이가 같은 두 DNA가 있을 때, 각 위치의 뉴클오티드 문자가 다른 것의 개수이다. 만약에 “AGCAT"와 ”GGAAT"는 첫 번째 글자와 세 번째 글자가 다르므로 Hamming Distance는 2이다.

우리가 할 일은 다음과 같다. N개의 길이 M인 DNA s1, s2, ..., sn가 주어져 있을 때 Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA s를 구하는 것이다. 즉, s와 s1의 Hamming Distance + s와 s2의 Hamming Distance + s와 s3의 Hamming Distance ... 의 합이 최소가 된다는 의미이다.

 

 

입력 :

첫 줄에 DNA의 수 N과 문자열의 길이 M이 주어진다. 그리고 둘째 줄부터 N+1번째 줄까지 N개의 DNA가 주어진다. N은 1,000보다 작거나 같은 자연수이고, M은 50보다 작거나 같은 자연수이다.

 

 

출력 :

첫째 줄에 Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA 를 출력하고, 둘째 줄에는 그 Hamming Distance의 합을 출력하시오. 그러한 DNA가 여러 개 있을 때에는 사전순으로 가장 앞서는 것을 출력한다.

 

 

 

 

 

풀이)

문제를 이해하는 것 자체가 너무 힘든 문제였다.

결국 풀이를 못 생각하다가 검색을 통해 다음과 같은 해법을 발견했다.

 

 

n, m = map(int, input().split())
 
li = []
for i in range(n):
    li += list(input())
 
answer = ""
total = 0
for i in range(m):
    a, t, g, c = 0, 0, 0, 0
    for j in range(n):
        if li[i + m * j] == "A":
            a += 1
        elif li[i + m * j] == "T":
            t += 1
        elif li[i + m * j] == "G":
            g += 1
        elif li[i + m * j] == "C":
            c += 1
 
    if max(a, t, g, c) == a:
        answer += "A"
        total += t + g + c
    elif max(a, t, g, c) == c:
        answer += "C"
        total += a + g + t
    elif max(a, t, g, c) == g:
        answer += "G"
        total += a + t + c
    elif max(a, t, g, c) == t:
        answer += "T"
        total += a + c + g
 
print(answer)
print(total)
 

 

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출처 : https://www.acmicpc.net/problem/1969

1969번: DNA